可能就发生在明天——日本列岛将荡然无存。这一惊人的科学论证，被展示在日本政府内阁会议上的各位大臣眼前，并引来了一片唏嘘声。而这一论证却得到了山本首相的重视，他下令立即成立特别灾害对策本部，并任命文部省大臣鹰森负责此项工作。在鹰森的领导下，东都大学地震研究所的田所雄介博士带领他的研究小组，完成了一系列对地壳的变化的调查和研究工作，并拿出了一整套试图将日本从即将沉没中拯救出来的方案。而在此期间，日本列岛各处的大地震不断、火山接连喷发，整个日本列岛陷入了一片恐慌之中……

    大难当头，日本全境开始撤离，但也不乏为拯救日本而默默做出贡献的人们：东京消防救援队的阿部玲子在危难时刻救助了像她一样失去亲人的小女孩美笑；田所博士手下二位年轻的潜艇操作员——小野寺俊夫和结诚慎司，在日本即将沉没之前，毅然操作潜艇潜入海底7000米处去点燃那能使日本与断裂的板块脱离的N1炸药，用他们年轻的生命换来了日本摆脱解难的安宁……